Nous sommes à l’ère Meiji, le Japon a subit un grand nombre de changements grâce au nouveau gouvernement qui est passé de l’isolationnisme à une expansion internationale.
Les humains peuvent désormais vivres en harmonie avec les Yōkai (démon), à condition que ceux-ci aient une license Yōkai-Humain.
Nous nous retrouvons à Kyōto où arrive Ryunosuke Sakamoto qui débarque de Shanghai avec son ami Yōkai, Nekomaru (qui vient tout juste d’être licencié) afin de voir sa mère.
Peu de temps après, notre héros apprend l’existence d’un groupe assez spécial : le Kidō Shinsengumi qui est chargé de capturer les Yōkai non-licenciés et de tenir le registre de tous les citadins.
Après avoir retrouvé sa mère, Ryunosuke se retrouvera embarqué dans les aventures du Kidō Shinsengumi.
