L’ histoire se passe au Japon.
Naoyaki Asaba est un jeune étudiant qui fait partie du club de journalisme de son lycée.
Durant tout l’été il a accompagné le président du club dans son excursion autour de la base militaire, visant à découvrir un certain OVNI, soit disant aperçu sous forme de lumière étrange durant la seconde guerre mondiale.
Les vacances achevées, il retourne à l’école et retrouve ses camarades. Parmi eux, une jeune fille du nom d’Iriya Kana qu’il avait la veille sauvé de la noyade, dans la piscine de la base militaire.
Celle-ci semble en savoir plus qu’elle ne devrait au sujet de la base, notamment des codes d’accès normalement gardés top secret.